現行の利用状況にあわせた運行日の見直しとして，上りの出水5：11発八代行き（6210D）と下りの八代6：41発西出水行き（6219D）の2本を平日のみの運行に変更し，土休日は運休とする．
　午後から夜間帯にかけて，列車の待ち時間を均等にするため運転間隔の調整を行なう．新八代に乗り入れている17時台の下り列車の出発時間を見直し，九州新幹線からの乗換時間を確保する．八代発の下り（佐敷・水俣方面）最終列車について，始発駅を八代から新八代に変更し，九州新幹線から佐敷・水俣方面へ向かう利用客の利便性向上を図る．
　八代・川内の各駅では，JR鹿児島本線との接続を改善する．また，出水では，夜間帯における九州新幹線との乗換時間を短縮する．
　このほか，利用状況にあわせた編成両数の変更や，一部列車における発着のりばの変更を実施する．2月1日（土）から実施している，始発から8時台までの一部列車の運休については，ダイヤ改正後も継続する．
　改正後の運行本数については，平日の上りが23本（現行24本），同下りが28本（現行29本），土休日の上りが21本（現行23本），同下りが25本（現行27本）となる（観光列車「おれんじ食堂」を除く）．

写真：肥薩おれんじ鉄道 「おれんじ食堂」　　黛　宏幸撮影　　2013-4-17

　観光列車「おれんじ食堂」については，運転士不足にともない，2025（令和7）年6月30日（月）までの間，全便運休とする．7月1日（火）以降についても，運行再開は未定としている．
　この間，観光列車「おれんじ食堂」の車両を使用した代替企画を実施する予定で，企画はその都度発表される．
　詳しくは，肥薩おれんじ鉄道ニュースリリースに掲載されている．

特記以外の写真は肥薩おれんじ鉄道ニュースリリースから