2021（令和3）年3月13日（土）のJRグループのダイヤ改正にともない，JR九州では，日豊本線の特急列車に大幅な見直しが行なわれました．
　今回のダイヤ改正では，特急“にちりん”・“きりしま”の運転本数削減にともなうダイヤの調整に加え，“にちりん”の一部列車の多客臨時列車化による延岡—宮崎空港間の“ひゅうが”の増発，佐伯以南で運転される特急列車の787系への車種統一などが実施されました．
このダイヤ改正により，南福岡車両区に所属する783系は日豊本線の特急運用から撤退したほか，5両編成に関しては同時に定期運用がなくなっています．また，大分車両センターに所属する787系4両編成は，今回のダイヤ改正で運用区間が小倉—鹿児島中央間に拡大し，日豊本線全線で787系の4両編成が見られるようになりました．
　なお，4両編成・小倉発着で運転される“にちりん”3号と20号は，小倉—大分間では車掌が乗務し，大分—宮崎空港間はワンマンで運転されます．