2022（令和4）年9月23日（金祝）に行なわれたJR九州のダイヤ改正にともない，九州各地で普通列車の本数削減や車両変更が実施されましたが，大分地区で運転されていたキハ200系の普通列車にも変化がありました．
　朝と夜の通勤時間帯に豊肥本線の大分—豊後竹田間で運転される4458Dと4429Dは，これまで，平日は4両，土曜・休日は2両で運転されていましたが，ダイヤ改正以降は曜日に関わらずキハ200形550番台とキハ220形の3両に変更されました．とくに平日の運転では，大分駅到着後にキハ220を1両連結し，5両で大分車両センターまで回送されており，キハ200系を用いる列車の中で最長の編成となっていましたが，ダイヤ改正にともない平日の4両運用や連結作業等が無くなりました．
　また，キハ220-206と，シーサイドライナー色で残るキハ220-209が大分車両センターから熊本車両センターに転属しており，キハ220形の運用で時折見られた，シーサイドライナー色の2両運転も見られなくなりました．