JR四国では，2021（令和3）年3月13日（土）のダイヤ改正にあわせて，土讃線の特急“南風”・“しまんと”の運用から2000系気動車が引退しました．
　最後の運用はダイヤ改正当日の“南風”1号，“しまんと”3号となりました．改正後も高知—中村間の“あしずり”，予讃線の“宇和海”では2000系の運転は続きますが，非貫通形先頭車の2000形（Mc1）は全車引退となります．