JR東日本では，2019（令和元）年12月31日（火），新津運輸区所属で只見線仕様となっているキハE120-3とキハE120-4の2両編成が羽越本線新発田—新津間で営業運転に就きました．
　12月下旬から，米坂線の運用に就いており12月31日の午後に新津へ戻っています．
　只見線（仙台支社）への転属は，新津運輸区に所属するキハE120形8両すべてで，現在までキハE120-5を除き改造工事が行なわれています．
　なお，キハE120-1＋キハE120-8は只見線（会津若松—会津川口間）で行なわれている試運転で使用されているようです．