伊賀鉄道は，2012（平成24）年10月1日（月）に開業5周年を迎えました．これを記念して，同日から200系全編成の前面助手側窓（200系201編成［SE51］と202編成［SE52］は伊賀神戸方のみ）に「おかげさまで開業5周年」と書かれたマークが掲出されています．
　また，「伊賀鉄道開業5周年記念入場券」と「伊賀鉄道開業5周年記念乗車券」が上野市駅で発売されており，郵送による取扱いも行なわれています．