2009（平成21）年7月4日（土）の中央西線5875列車に，EF64 1041とEF64 1040の国鉄色重連が，愛知機関区転属後初めて充当されました．
　EF64形1000番台は，6月2日（火）の中央西線81列車にて1024号機・1026号機の更新色重連が運用を開始しましたが，翌日の6883列車をけん引中に故障が発生し，その後の1000番台の運用が見合わせとなっていました．
　ちなみに，7月4日の81列車は，愛知区で最後の2両となった国鉄色の0番台である31号機・34号機の重連が充当されました．