長らくの間，岳南富士岡駅構内に3編成が留置されていた5000系ですが，2008（平成20）年7月中旬から解体が行なわれています．
　7月23日（水）現在，留置されている3編成のうち1編成は完全に解体されており，もう1編成も半分以上解体，窓ガラスや座席もすべて撤去されていることから，今後全編成が解体されるものと思われます．